Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf88P0DMB2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms