Protein–RNA interactions for Protein: P0CX20

YRF1-1, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 1, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-1P0CX20 snR36snR36 182 nt-0.87□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 BER1YLR412W 825 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 snR5snR5 204 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.89□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 snR161snR161 161 nt-0.89□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 HUR1YGL168W 333 nt-0.9□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 YLR217WYLR217W 324 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 YPT6YLR262C 648 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 YPR039WYPR039W 336 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-1P0CX20 YGR228WYGR228W 345 nt-0.91□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 YOL029CYOL029C 606 nt-0.91□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 MRPL32YCR003W 552 nt-0.92□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 PCF11YDR228C 1881 nt-0.92□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 APQ13YJL075C 417 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 YPL182CYPL182C 384 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 RPF1YHR088W 888 nt-0.95□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 POP7YBR167C 423 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 HMRA2YCR096C 360 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 EST1YLR233C 2100 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-1P0CX20 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 RPS25BYLR333C 327 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 SDH7YDR511W 402 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YHL041WYHL041W 450 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 SGF11YPL047W 300 nt-0.99□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YCR100CYCR100C 951 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YNL058CYNL058C 951 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 TSC3YBR058C-A 243 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YCR001WYCR001W 315 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YPR092WYPR092W 306 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.03□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YER135CYER135C 393 nt-1.03□□□□□ -2.57
YRF1-1P0CX20 YDL011CYDL011C 324 nt-1.03□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.03□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 SNU13YEL026W 381 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YER079WYER079W 633 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 AGA2YGL032C 264 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YGR025WYGR025W 303 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 BLI1YKL061W 342 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YGL230CYGL230C 444 nt-1.05□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YLR041WYLR041W 321 nt-1.05□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YER175W-AYER175W-A 165 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YLR282CYLR282C 342 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 snR9snR9 187 nt-1.07□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YLR334CYLR334C 381 nt-1.07□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 MND1YGL183C 660 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-1.09□□□□□ -2.58
YRF1-1P0CX20 FYV7YLR068W 456 nt-1.1□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1.11□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 CMC1YKL137W 336 nt-1.11□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.12□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YHR130CYHR130C 336 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YBL062WYBL062W 381 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YNL303WYNL303W 348 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YOR015WYOR015W 360 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YDR366CYDR366C 399 nt-1.14□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YMR254CYMR254C 309 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 ZEO1YOL109W 342 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YPL068CYPL068C 882 nt-1.16□□□□□ -2.59
YRF1-1P0CX20 YBL071CYBL071C 309 nt-1.18□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YDR426CYDR426C 378 nt-1.19□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YKL044WYKL044W 321 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 AIM29YKR074W 468 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YPL229WYPL229W 621 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 SCEIQ0160 708 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YAR029WYAR029W 225 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YKL083WYKL083W 615 nt-1.22□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.22□□□□□ -2.6
YRF1-1P0CX20 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.23□□□□□ -2.61
YRF1-1P0CX20 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.24□□□□□ -2.61
YRF1-1P0CX20 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.24□□□□□ -2.61
YRF1-1P0CX20 YJL182CYJL182C 318 nt-1.26□□□□□ -2.61
YRF1-1P0CX20 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.26□□□□□ -2.61
YRF1-1P0CX20 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.28□□□□□ -2.61
YRF1-1P0CX20 YGL182CYGL182C 324 nt-1.29□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.3□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 APQ12YIL040W 417 nt-1.31□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.32□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 YJR087WYJR087W 351 nt-1.33□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 YIL029CYIL029C 429 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 snR49snR49 165 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 YDL016CYDL016C 303 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-1P0CX20 YIL032CYIL032C 357 nt-1.35□□□□□ -2.63
YRF1-1P0CX20 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-1.36□□□□□ -2.63
YRF1-1P0CX20 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.36□□□□□ -2.63
YRF1-1P0CX20 YFL063WYFL063W 456 nt-1.38□□□□□ -2.63
YRF1-1P0CX20 CBS1YDL069C 690 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRF1-1P0CX20 YFL012WYFL012W 447 nt-1.39□□□□□ -2.63
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