Protein–RNA interactions for Protein: P0C869

PLA2G4B, Cytosolic phospholipase A2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4BP0C869 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLA2G4BP0C869 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms