Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR29P0C7W0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR29P0C7W0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms