Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP1P09874 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP1P09874 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP1P09874 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP1P09874 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP1P09874 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP1P09874 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARP1P09874 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARP1P09874 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms