Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRPRAP08240 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRPRAP08240 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms