Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFMP07197 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFMP07197 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFMP07197 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEFMP07197 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEFMP07197 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEFMP07197 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEFMP07197 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEFMP07197 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEFMP07197 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms