Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGAVP06756 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAVP06756 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms