Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB3P05106 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms