Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD2O96028 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NSD2O96028 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
NSD2O96028 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NSD2O96028 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSD2O96028 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NSD2O96028 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NSD2O96028 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NSD2O96028 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms