Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD3O95983 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD3O95983 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD3O95983 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD3O95983 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms