Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX7O95931 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX7O95931 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms