Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC24BO95487 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC24BO95487 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms