Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms