Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD4O95243 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD4O95243 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD4O95243 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD4O95243 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms