Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL5O76039 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL5O76039 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms