Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA4O75676 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA4O75676 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms