Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms