Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKAB2O43741 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms