Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1O43719 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1O43719 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms