Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATCO43716 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATCO43716 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GATCO43716 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms