Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN4O43707 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms