Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN2DO15399 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN2DO15399 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms