Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CEP290O15078 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP290O15078 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP290O15078 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CEP290O15078 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CEP290O15078 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP290O15078 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP290O15078 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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CEP290O15078 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP290O15078 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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CEP290O15078 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP290O15078 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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