Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1AO15047 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1AO15047 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms