Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3C2BO00750 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3C2BO00750 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3C2BO00750 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2BO00750 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2BO00750 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2BO00750 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3C2BO00750 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms