Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L13C9JLJ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms