Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B4DXG7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B4DXG7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
B4DXG7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4DXG7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DXG7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DXG7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DXG7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DXG7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DXG7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4DXG7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4DXG7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4DXG7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms