Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SRRM5B3KS81 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms