Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CYSRT1A8MQ03 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.3 ms