Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DBX1A6NMT0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms