Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM200CA6NKL6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms