Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LIPT2A6NK58 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms