Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM49BA6NDI0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM49BA6NDI0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms