Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms