Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms