Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 BRDT-204ENST00000394530 3207 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 AL445531.1-201ENST00000562653 1728 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
POLR2AP24928 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms