Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL034372.1-201ENST00000407586 754 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC079584.1-201ENST00000426716 464 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CCNC-215ENST00000523799 1035 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TBC1D21-202ENST00000535547 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 CREM-218ENST00000460270 1416 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 GABRR3-202ENST00000472788 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PDK4Q16654 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PDK4Q16654 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PDK4Q16654 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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PDK4Q16654 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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PDK4Q16654 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 AC245100.4-203ENST00000635493 1357 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDK4Q16654 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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