Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC104046.1-201ENST00000559487 406 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC007728.2-202ENST00000567728 1150 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 RN7SL804P-201ENST00000582466 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 SRP68P1-201ENST00000584247 269 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC007326.3-201ENST00000636418 176 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 DEPDC1B-202ENST00000453022 1569 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CD247P20963 CARF-216ENST00000444724 2854 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 THAP12P3-201ENST00000456373 2266 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 SOX5-203ENST00000396007 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 KRBOX1-201ENST00000383748 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 DNAJB1-202ENST00000396969 1287 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL031229.1-201ENST00000404273 224 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 RPSAP2-201ENST00000416785 888 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 RPSAP53-201ENST00000433498 862 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 PRB4-202ENST00000445719 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 RN7SL496P-201ENST00000470372 290 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC006065.2-201ENST00000536978 211 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC089998.4-201ENST00000552532 459 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 NUTF2P6-201ENST00000560892 385 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 RPL7L1P5-201ENST00000590816 738 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC100843.3-201ENST00000591796 259 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC131159.2-201ENST00000613236 702 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AC027139.2-201ENST00000615639 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CD247P20963 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms