Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL378P-201ENST00000582657 298 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKLF-CMTM1-205ENST00000615332 395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSIG1-201ENST00000217957 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD226-207ENST00000582621 1458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSDMB-204ENST00000394179 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFB2-OT1-201ENST00000625474 1371 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAM1P6-201ENST00000425684 747 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157392.2-201ENST00000449462 474 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013439.1-201ENST00000449965 1239 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00445-202ENST00000456848 643 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AARSP1-201ENST00000514795 453 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIF1A-AS2-201ENST00000554254 533 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023284.4-201ENST00000564248 374 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001021.2-201ENST00000577935 544 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL279P-201ENST00000582185 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR2467-201ENST00000584559 81 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233702.11-201ENST00000598588 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY2-205ENST00000627859 210 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC38-207ENST00000629918 162 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00581-201ENST00000630914 990 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450332.1-203ENST00000638742 1268 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRF1-202ENST00000371243 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161725.1-201ENST00000591577 1351 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 406.1 ms