Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC083841.1-201ENST00000523657 670 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ZNF174-205ENST00000575752 1068 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 GNRH1-201ENST00000276414 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SCN2BO60939 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SCN2BO60939 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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