Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP75-201ENST00000363070 296 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 KRBOX1-201ENST00000383748 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CNOT4P1-201ENST00000417432 1199 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC128709.3-201ENST00000420213 626 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TRIM26BP-206ENST00000427723 753 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC00544-202ENST00000481738 575 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL096701.3-202ENST00000483736 615 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:18790-205ENST00000504171 980 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 MIR3945HG-202ENST00000511703 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 STMN2-203ENST00000518491 585 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL442663.4-201ENST00000555304 289 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC125421.2-201ENST00000580370 583 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC01444-202ENST00000581211 654 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 FAM95B1-209ENST00000590863 789 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 GMFG-210ENST00000601387 497 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC007161.2-201ENST00000604734 1109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.165-201ENST00000615681 260 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-203ENST00000540678 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 DCN-220ENST00000552962 1930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC068044.1-201ENST00000441585 1978 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 PSG11-202ENST00000320078 1575 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC01588-217ENST00000635379 1595 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL589642.1-201ENST00000430787 2582 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SNORD83A-201ENST00000386747 95 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 ZNF816-ZNF321P-201ENST00000391777 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM211-202ENST00000423535 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC103563.4-201ENST00000454384 368 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 GK-AS1-201ENST00000464659 651 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL645924.2-201ENST00000508865 900 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC027698.1-201ENST00000518536 625 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC008632.1-201ENST00000519400 753 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms