Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 OR11G2-201ENST00000357366 1038 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ARR3-202ENST00000374495 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL034372.1-201ENST00000407586 754 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RPL3P4-201ENST00000417615 423 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC007683.1-201ENST00000432746 591 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DNAJC9-AS1-203ENST00000457758 548 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ADAM3A-206ENST00000484602 1046 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LEF1-AS1-205ENST00000508286 444 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 EGFLAM-AS1-201ENST00000508986 331 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC114812.3-201ENST00000509542 730 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 IGHVIV-44-1-201ENST00000519334 338 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC02489-201ENST00000527239 354 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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PDCD1Q15116 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC104046.1-201ENST00000559487 406 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC015818.5-201ENST00000578659 356 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC090358.1-201ENST00000579862 852 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL109806.1-201ENST00000623967 1248 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL589666.2-201ENST00000624603 618 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL158175.1-201ENST00000634327 1127 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL390195.2-201ENST00000564771 2023 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDCD1Q15116 RAD21L1-203ENST00000409241 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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