Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
S4R3F8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
S4R3F8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
S4R3F8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms