Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms