Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP16Q9Y5T5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP16Q9Y5T5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms