Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRPRBQ9Y5M8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms