Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms