Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NFE2L3Q9Y4A8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFE2L3Q9Y4A8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms