Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HCN4Q9Y3Q4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HCN4Q9Y3Q4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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